大多数的恶性淋巴瘤是没有明确的发病原因,只有少数的淋巴瘤可能有比较明确的发病原因,波基特淋巴瘤NKT淋巴细胞淋巴瘤,霍奇金淋巴瘤可能和一些因素有关系。如EB病毒激活癌基因在免疫损伤后就容易继发有淋巴瘤,但是并不是感染了EB病毒就一定会得淋巴瘤,就像抽烟的人不一定得肺癌,但是肺癌的病人也不一定都抽过烟。
正常人群当中大部分都感染过EB病毒,但是为什么只有少数人会慢性的长期的携带,这可能与自身有某些基因的缺陷有关系。边缘区的淋巴瘤有些是和慢性炎症的刺激有关,如眼眶的淋巴瘤可能和养宠物有衣原体的感染有关系,甲状腺的淋巴瘤可能和自身免疫性甲状腺炎也有一定的关系。胃的MALT淋巴瘤和幽门螺旋杆菌的感染是密切相关的,有些淋巴瘤是因为基因重排而引起淋巴细胞恶性的转变。但总体来讲,慢性的炎症有发生长期的刺激,尤其是免疫系统疾病,或者是由免疫损伤的病人,更容易激发这种淋巴瘤。