部队公寓不是公有住房，两者区别如下：

1、军队公寓住房，是指划定在公寓区内，保障在职军队人员工作居住的住房。公寓住房主要保障军官、文职干部、士官和在编职工在职期间住用，不能出售，离职要迁出。

2、公寓住房的住用人员离退休、转业、复员、调动工作后已安排住房或购买住房的，应当限期腾出现住用的公寓住房。对现居住在公寓区内的其他人员，应采取调整、置换和安排购房等办法逐步迁出。

3、公寓房面积指标是包含全部公摊面积在内的建筑面积指标。师职住房面积标准为92-120平方米，团职住房面积标准为72-92平方米，营职以下住房面积标准为54-72平方米。

4、公有住房承租人享有房屋使用权，可以一直居住，但不能出售。